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Cut&Tag優(yōu)勢(shì)及解決方案

發(fā)布時(shí)間: 2022-02-18  點(diǎn)擊次數(shù): 2335次

技術(shù)簡(jiǎn)介

CUT&TagCleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白質(zhì)-DNA互作關(guān)系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技術(shù),適用于無(wú)ChIP級(jí)別抗體的蛋白研究。與傳統(tǒng)的ChIP-Seq研究方法相比,該技術(shù)無(wú)需交聯(lián)、超聲打斷、末端抹平和接頭連接等操作,因此具有省時(shí)高 效、所需的樣品量少、背景信號(hào)低和可重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),甚至可用于單細(xì)胞水平測(cè)序。CUT&Tag有望將蛋白質(zhì)-DNA互作的研究變成一種類似PCR反應(yīng)的常規(guī)操作,對(duì)基因調(diào)控、表觀遺傳等領(lǐng)域的研究具有革命性的意義。

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

  樣品起始量低:能夠?qū)吧倭繕悠愤M(jìn)行分析

  無(wú)需ChIP級(jí)別抗體:無(wú)需提供ChIP級(jí)別抗體

  性價(jià)比高:背景噪音低,所需測(cè)序深度少

  實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好:實(shí)驗(yàn)重復(fù)結(jié)果一致性好

技術(shù)原理

ChiTagProtein AG蛋白與Tn5轉(zhuǎn)座酶的融合蛋白,當(dāng)抗體結(jié)合目的蛋白(如轉(zhuǎn)錄因子、組蛋白等)后,Protein AG蛋白可直接結(jié)合抗體,攜帶的Tn5轉(zhuǎn)座酶可特異性的切割目的蛋白附近的DNA pian段,并將DNA pian段連上接頭,文庫(kù)構(gòu)建之后可進(jìn)行高通量測(cè)序。

1.png

圖注: CUT&Tag實(shí)驗(yàn)流程

案例解析

CUT&Tag技術(shù)研究蛋白質(zhì)-DNA互作的優(yōu)勢(shì)

原文:CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells

期刊:Nature Communications 發(fā)表時(shí)間:20190429 影響因子: 11.878

在生物學(xué)研究中,DNA與蛋白質(zhì)之間的互作是至關(guān)重要的,參與基因的表達(dá)、調(diào)控、復(fù)制、重組和修復(fù)以及RNA的轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯和調(diào)控等多個(gè)過(guò)程,幾乎涉及所有的生命活動(dòng)。目前研究?jī)烧呋プ鞯姆椒ê芏?,作者選擇了傳統(tǒng)的研究手段ChIP-seq,優(yōu)化的CUT&RUN方法,以及新方法CUT&Tag共同研究組蛋白H3K27me3。通過(guò)比對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)CUT&Tag*低的背景噪聲以及zui強(qiáng)的信號(hào)。通過(guò)對(duì)H3K4me1修飾物進(jìn)行分析,顯示CUT&Tag的靈敏度*高,實(shí)驗(yàn)可重復(fù)性*好。

2.png

圖注. CUT&Tag方法的優(yōu)點(diǎn)

北京和一生物作為Epicypher的國(guó)內(nèi)授權(quán)代理,為您提供Cut&Tag實(shí)驗(yàn)所需的全套的試劑以及耗材,歡迎垂詢!

產(chǎn)品名稱

貨號(hào)

規(guī)格

品牌

CUTANA pAG-Tn5 for   CUT&Tag

15-1017

50reactions

Epicypher

Anti-Mouse Secondary Antibody for CUTANA CUT&Tag Workflows

13-0048

250reactions

Epicypher

Anti-Rabbit Secondary Antibody for CUTANA CUT&Tag Workflows

13-0047

250reactions

Epicypher

CUTANA Rabbit IgG CUT&RUN   Negative Control Antibody

13-0042

100µg

Epicypher

Histone H3K4me3 Antibody: SNAP-ChIP® Certified, CUTANA CUT&RUN Compatible

13-0041

100µg

Epicypher

CUTANA E. coli Spike-in DNA

18-1401

100ng

Epicypher


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